По словам главы ФСИН, Ходорковский был помещен в отдельную камеру "по объективным обстоятельствам", в целях безопасности. Сейчас экс-глава "ЮКОСа" находится в отряде. Кроме того, Калинин отметил, что все взыскания, наложенные на Ходорковского, объективны. "Он должен выбирать круг общения", - добавил глава ФСИН.
Ходорковский, отбывающий наказание в колонии города Краснокаменск Читинской области, был помещен в отдельную камеру 20 апреля после того, как один из осужденных поранил ему заточкой лицо. Решение изолировать Ходорковского руководство ФСИН объяснило стремлением прекратить спекуляции по поводу угрозы жизни Ходорковского. Подавать в суд на осужденного Кучму, совершившего нападение, экс-глава "ЮКОСа" не стал, сочтя его действия неадекватными. На этом основании уголовное дело возбуждено не было.
В мае 2005 года Мещанский суд Москвы признал Ходорковского и бывшего руководителя МФО "МЕНАТЕП" Платона Лебедева виновными в уклонении от уплаты налогов и мошенничестве в крупном размере и приговорил к девяти годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии общего режима. 22 сентября Мосгорсуд подтвердил приговор, снизив при этом срок наказания до 8 лет. 15 октября Ходорковский был доставлен в исправительную колонию, которая находится в 550 километрах от Читы на окраине города Краснокаменск. Лебедев был отправлен в колонию №3 в поселке Харп ЯНАО.