Администрация колонии объявила Ходорковскому выговор в середине декабря 2005 года, когда он работал в швейном цехе учеником швеи-моториста, за то, что он покинул свое рабочее место без разрешения администрации.
Между тем, 3 мая Мосгорсуд признал законным и обоснованным приговор Ходорковскому, по которому он был осужден на восемь лет лишения свободы. Председатель суда отказала в удовлетворении надзорной жалобы защиты экс-главы "ЮКОСа" на обвинительный приговор.
Мещанский суд Москвы в мае 2005 года приговорил Ходорковского и главу "МЕНАТЕП" Платона Лебедева к девяти годам лишения свободы, признав их виновными, в том числе, в уклонении от уплаты налогов. Позже кассационная инстанция Мосгорсуда снизила обоим срок наказания до восьми лет заключения. С учетом уже прошедших двух лет заключения бывшим предпринимателям предстоит провести в колонии еще 6 лет. После вступления приговора в законную силу осужденные были этапированы для отбывания наказания - Ходорковский в Краснокаменскую колонию Читинской области, а Лебедев - в поселок Харп Ямало-Ненецкого АО.