"Продолжают укрепляться формальные и неформальные преференции, которые получает Русская православная церковь (РПЦ), а также мусульманские и буддистские организации в соответствующих республиках". Эти преференции ставят под вопрос секулярный характер российского общества. Именно это вызывает опасения, так как "механизмы защиты свободы совести тесно связаны с секулярным характером государства". Чаще всего в этой связи обсуждается проблема присутствия религии в школе, но не менее серьезна и ситуация, складывающаяся в армии и в правоохранительных органах, считают авторы доклада. Отмечается необходимость общественной дискуссии по проблеме присутствия религии в школе, а для преодоления случаев дискриминации религиозных меньшинств они предлагают добиваться исполнения чиновниками действующего законодательства.
В центре "Сова" полагают, что больше всего проблем у религиозных организаций возникает не в связи с регистрацией по закону о неправительственных организациях, а в связи с созданием и использованием богослужебных зданий и помещений. "В первую очередь проблемы возникают у мусульман, протестантов, особенно "пятидесятников" и новых религиозных движений. Похоже, что сопротивление чиновников обусловлено не реальной "агрессивной динамикой" этих религиозных течений, а распространенным в обществе преувеличенным страхом перед этой "экспансией", - говорится в докладе.
Также авторы доклада отмечают, что все большее беспокойство вызывают злоупотребления в борьбе с экстремизмом и терроризмом. Жертвами этих злоупотреблений становятся в основном, но не исключительно, представители независимых мусульманских групп, "пусть даже некоторые из них вполне правомерно привлекли внимание правоохранительных органов".
Правозащитники также обеспокоены ростом в России числа актов вандализма с мотивом религиозной ненависти. "В течение 2006 года мы зафиксировали 25 актов вандализма с явным мотивом религиозной ненависти в отношении храмов и культовых сооружений и объектов - православных храмов, мечетей, синагог, молитвенных домов протестантов, языческого капища, буддистской мандалы", - говорится в докладе.
