Предупреждение было вынесено в связи с тем, что 2 февраля 2006 года Газета.Ru разместила на своем сайте материал "Карикатурная война", рассказывающий о реакции мусульман на публикацию карикатур на пророка Мухаммеда в одной из датских газет. При этом материал был проиллюстрирован рядом карикатур, вокруг которых ранее и разразился скандал.
Росохранкультура расценила эту публикацию как экстремистскую, признав, что Газета.Ru нарушила требование статьи 4 закона о СМИ и статью 11 закона о противодействии экстремистской деятельности. На этом основании изданию было вынесено официальное предупреждение. После этого карикатура была снята с сайта, однако издание решило оспорить правомерность вынесенного предупреждения и подало иск в Московский арбитражный суд с просьбой его аннулировать.