Дело в отношении Миронова по статье 282 УК РФ (возбуждение национальной, расовой или религиозной вражды) было возбуждено в конце 2003 года. Основанием послужили выпущенные избирательным штабом Миронова бюллетени с антисемитскими высказываниями. В 2003 году Миронов баллотировался на пост губернатора Новосибирской области. В ходе предвыборной кампании выпускал газеты под названиями "Первый Сибирский фронт" и "Второй Сибирский фронт", в которых печатал статьи с антисемитскими высказываниями. В агитационных материалах было указано, что "92 процента жителей области - русские, а во главе, почему-то, - нерусский". По информации следствия, некоторые из высказываний, в частности, якобы были адресованы к ныне действующему губернатору области Виктору Толоконскому.
Миронова, который более трех лет находился в розыске, задержали 11 декабря 2006 года в Москве и затем этапировали в Новосибирск, где 13 декабря по решению местного суда ему избрана мера пресечения в виде ареста.
От должности главы Роскомпечати Борис Миронов был отстранен 2 сентября 1994 года указом президента Российской Федерации после опубликования рядом газет статей, обвиняющих его в крайне националистических взглядах.