25 июля 2003 года Северо-Кавказский окружной военный суд признал Буданова виновным в убийстве Кунгаевой, совершенном летом 2000 года, и приговорил его к десяти годам лишения свободы в колонии строгого режима. В 2004 году Буданов подавал ходатайство о своем помиловании, однако затем сам же отозвал его из-за нерешенности вопроса с гражданством и неопределенностью с будущим местом жительства и работы.
По утверждению Буданова, Кунгаева была снайпером. 31 декабря 2002 года суд вынес решение по делу Буданова, признав его невменяемым. С решением не согласились потерпевшие и гособвинение, опротестовавшие приговор в военной коллегии Верховного суда.
Свидетели на процессе заявляли, что в последние несколько месяцев до инкриминированных Буданову преступлений у командира наблюдались вспышки гнева, и он мог в течение 15-20 минут ругать за провинность подчиненного. Начальник разведки также показал, что он неоднократно видел Буданова "разговаривающим самим с собой".