Генеральная прокуратура в июле 2005 года предъявила Пичугину обвинения в организации убийства предпринимателя Корнеевой, главы администрации Нефтеюганска Петухова, а также в двух неудавшихся покушениях на предпринимателя Рыбина. Объем уголовного дела составляет 73 тома.
Ранее Мосгорсуд приговорил Пичугина к 20 годам лишения свободы в колонии строгого режима. Суд присяжных признал его виновным в убийстве в 2002 году двоих жителей Тамбова - Ольги и Сергея Гориных. Помимо этого коллегия сочла, что следствию удалось доказать его вину в организации покушения на бывшего начальника Управления общественных связей мэрии Москвы, экс-советника бывшего главы "ЮКОСа" Михаила Ходорковского Ольгу Костину в ноябре 1998 года.
25 июля 2006 года Алексею Пичугину исполняется 44 года.
